Engin Günaydın comenzó sus estudios universitarios en el Conservatorio de la Universidad Hacettepe, pero en su segundo año se cambió a la Universidad Mimar Sinan, donde se graduó en teatro. Desde 1995 participó en numerosas series de televisión. En 2001, actuó en la película Yazgi de Zeki Demirkubuz, por la que recibió el premio al Mejor Actor de Reparto en el Festival de Cine de Ankara. En 2005 se unió al elenco de la comedia Avrupa Yakasi (2006-2009) como Burhan Altintop, que se convirtió en su papel más famoso. Escribió el guion y protagonizó Vavien (2009), dirigida por los Hermanos Taylan. Por este trabajo, ganó varios premios a la escritura de guiones en el Festival de Cine de Estambul, los premios Yesilcam y los premios Siyad. Años más tarde compartió el premio al Mejor Actor del Festival Internacional de Cine de Adana Golden Boll en 2012 junto con Ilyas Salman por su papel en Inside. En 2020 vuelve a trabajar con los hermanos Taylan interpretando al protagonista de la nueva serie de Netflix El dilema de Aziz.