Ponyo y el secreto de la sirenita narra la historia de Sosuke, un niño de 5 años que vive una vida tranquila en un acantilado junto al mar con su madre Lisa hasta que encuentra un hermoso pez dorado atrapado en una botella en la playa y al rescatarla, la nombra Ponyo. Pero ella no es un pez dorado ordinario: es hija de un mago magistral y una diosa del mar. Ponyo usa la magia de su padre para transformarse en una niña y rápidamente se enamora de Sosuke, pero el uso de una hechicería tan poderosa causa un desequilibrio peligroso en el mundo. El padre de Ponyo la regresa al reino del océano, pero el deseo de Ponyo es tan poderoso que ella se libera, y en el proceso, derrama una colección de elixires mágicos que ponen en peligro la aldea de Sosuke. A medida que la luna se acerca constantemente a la tierra y el padre de Ponyo envía las poderosas olas del océano para encontrar a su hija, los dos niños se embarcan en una aventura única para salvar el mundo y cumplir los sueños de Ponyo de convertirse en humana.
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