Un día cualquiera, un joven estudiante de secundaria, solitario e introvertido, encuentra, por accidente, un pequeño cuaderno en un hospital. El libro lleva por nombre “Vivir con la muerte” y se trata del diario de una compañera de la escuela, Sakura Yamauchi, en el cual relata su experiencia diaria, mientras vive una enfermedad pancreática terminal. Su padecimiento es algo que ha mantenido oculto, por temor a que reciba un trato diferente y sólo su familia lo sabe. Ahora que el solitario estudiante también lo conoce, él decide buscar a Sakura, devolverle el diario y convertirse en una persona que será su sustento vital. Entre ellos se forma una relación donde comparten todas sus alegrías, pero también todas sus penas y preocupaciones, factores externos a la enfermedad de Sakura que han convertido sus días en una interminable pesadilla. En Me quiero comer tu páncreas, el joven también es capaz de encontrar algo diferente en la chica, en su alegría y su tenacidad a pesar de las circunstancias, herramientas que tratará de adaptar para cambiar sus días.
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