En Doom, la puerta al infierno, un grupo de científicos, en el año 2026, ha descubierto un portal, en las profundidades del desierto de Nevada, que conecta con una antigua ciudad en Marte. Llamado como “el Arca”, a lo largo de 20 años, varios especialistas provenientes de todo el mundo han investigado la conexión y la posibilidad de la existencia de otros agujeros que podrían ayudar a propiciar la vida humana en dicho planeta. Cuando, en 2046, se han hecho suficientes e importantes avances, la investigación cesa de mandar reportes, las comunicaciones han fallado y se teme que algo trágico ha sucedido. Así, un escuadrón de marines espaciales es enviados a investigar los extraños sucesos que tienen origen con el descubrimiento de antiguos esqueletos de una raza humanoide genéticamente modificada y mejorada, cuyos descendientes han permanecido ocultos por siglos y ahora han despertado y amenazan con transportarse a la Tierra.
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