La historia se desarrolla a principios de la década de los 80´s, cuando Charlie Wilson, delegado del Segundo Distrito de Texas en el congreso de los Estados Unidos, forma parte de dos importantes comités el política exterior y operaciones encubiertas. Detrás de su imagen de mujeriego y vividor acompañada de noticias sobre escándalos y conuistas, se esconde un hombre con un sentido político agudo, un sólido conocimiento de la escena internacional, un patriotismo a toda prueba y un compromiso con las causas perdidas. Presionado por su principal partidario conservador, la socialista de Houston Joanne Herring, Wilson se entera de la situación que enfrenta la gente a causa de la brutal ocupación soviética en Afganistán. En La guera de Charlie Wilson, con la ayuda de un agente de la CIA, Gustav "Gust" Avrakotos, Wilson dedica sus esfuerzos políticos a suministrar a los mujahideen afganos las armas y el apoyo para derrotar a la Unión Soviética; sin embargo, eventualmente se entera de que, si bien se puede obtener la victoria militar, hay otras consecuencias que se ignoran para desgracia de todos.