En Beethoven 3, la familia Newton continúa con su vida junto a su amada mascota. Todas las mañanas mientras los papás van a trabajar y los niños a la escuela, Beethoven va a pasear al parque y un día se encuentra con la hermosa San Bernardo hembra Missy. En seguida surge entre ellos un romance que tiene como resultado cuatro adorables cachorros. La interesada dueña de Missy, Regina, está usándola para negociar en su divorcio por lo que se la lleva lejos la campo. Por un tiempo los niños Newton cuidan a los cachorros lo más que pueden, a escondidas de su papá, pero cuando éste se entera logran convencerlo de adoptar a los cachorros. Los problemas realmente empiezan cuando Regina quiere hacerse de los cachorros para venderlos por miles de dólares. Los Newton, Beethoven y Missy harán todo por protegerlos.
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