Yaiba es un joven que ha vivido en la jungla desde que tiene memoria. Su padre lleva años entrenándolo como samurái, así que éste en la actualidad posee grandes habilidades que lo han ayudado a sobrevivir en este lugar. A causa de un incidente, Yaiba y su padre regresan a Japón y el chico se da cuenta que posee un trasfondo familiar legendario, por lo que nada de su entrenamiento ha sido en vano, así que ahora que está en su verdadero hogar deberá encargarse de completar su misión: luchar contra la maldad. Yaiba buscará convertirse en el mejor samurái y salvaguardar a su comunidad, pues hay toda clase de amenazas rodeándolos constantemente, además de que se hace de un enemigo, un joven llamado Takeshi Onimaru, quien tras perder en un duelo contra Yaiba decide usar una espada legendaria de su familia para así enfrentarse una vez más a Yaiba y vencerlo gracias a los poderes del dios que se encuentra encerrado en esta espada. Sólo que Takeshi se transforma en un demonio y ahora se encargará de declararle la guerra a Yaiba, así que éste deberá buscar una forma de contrarrestarlo. Takeshi se ha vuelto más fuerte y poderoso, por lo que representa una amenaza, así que Yaiba emprenderá una nueva aventura para así lograr vencer a su rival.