La serie se ubica en el mundo de Skylands, en donde el personaje principal, Spyro el dragón, y sus amigos Stealth Elf, Pop Fizz, Jet-Vac y Eruptor son los nuevos integrantes en la Skylanders Academy. Conforme la oscuridad comienza a crecer y a volverse un peligro para el equilibrio de la paz en Skylands, el Maestro Eon se tiene que recurrir a congregar un grupo de héroes para proteger el universo de los malvados Kaos y los Doom Raiders. Combinando sus personalidades y superpoderes basados en los elementos, Spyro y sus compañeros tendrán que dejar de lado el orgullo, a medida que se unen para mantener la armonía y el equilibrio en su tierra. Las enseñanzas del Maestro Eon guiarán a los aprendices a comprender lo que significa ser un Skylander mientras luchancontra los villanos de Skylands.
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