La temporada 4 abarca nueve días y comienza con los náufragos en espera de ser rescatados por la tripulación de carga en alta mar. Pero cuando cuatro extraños llegan a la isla en helicóptero, Jack y otros comienzan a cuestionar las intenciones de sus supuestos rescatadores: el físico Daniel Faraday, la antropóloga cultural Charlotte Lewis, la mediana Miles Straume y el piloto Frank Lapidus. Los cuatro tienen un motivo personal para venir a la isla, y pronto queda claro que rescatar a los náufragos no es su máxima prioridad. El objetivo principal de la tripulación de carga, enviado por Charles Widmore, es capturar a Benjamin Linus y traerlo de vuelta con vida. Algunos náufragos, como Hurley, Claire y Sawyer, están preocupados por la advertencia final de Charlie sobre el carguero y deciden seguir a Locke, que no tiene ningún interés en dejando la isla, al cuartel de Dharma.