Situada tras el enfrentamiento de Goku con el monstruo Bu, la Tierra se encuentra atravesando una época de paz, así que Goku junto a sus fieles amigos se dedican a disfrutar de estos instantes y a seguir entrenando. Goku nunca baja la guardia en ningún momento y siempre está en busca de cosas que lo hagan más fuerte, por lo que cuando las esferas del dragón desencadenan un extraño evento, él y sus amigos terminarán siendo pequeños nuevamente, incluso algunos regresarán a sus etapas de bebé. Para poder arreglar todo lo que ha ocurrido, Goku tendrá que adentrarse en diferentes aventuras para así revertir lo que les sucedió, sólo que como nuevamente es un niño, hará uso de su bastón mágico que le ayudará en las peleas que deba sortear. Junto a Shin, el dios supremo de su universo, Goku se sumergen en nuevo mundo donde intentará averiguar qué o quién pidió como deseo que todos ellos volvieran a ser niños, ya que esto también generará grandes peligros tanto para la Tierra como a toda la galaxia.