Nido de Ratas sucede en los muelles de la ciudad de Nueva York, en donde sólo una ley controla la operación y a los cientos de empleados que trabajan ahí, la ley de la mafia, controlada por Johnny Friendly, jefe del sindicato portuario, quien utiliza los métodos más crueles y salvajes para imponer su orden. Aunque la policía y las comisiones de delitos saben de sus operaciones ilícitas, nadie es capaz de hacer nada al respecto. El hombre de mayor confianza de Johnny es Charley Malloy, quien ha traído a los muelles a su hermano Terry, un antiguo y prometedor boxeador que se vio forzado a abandonar su carrera cuando perdió una pelea a propósito, para facilitar una apuesta que Friendly había hecho. Cuando un conocido trabajador portuario aparece muerto, su hermana, Edie, se presenta para entender los sucesos. El recién fallecido estaba por testificar ante la comisión y su muerte fue provocada por ello. Terry decide que se ha cansado de la situación y se una Edie para tratar de detener al terrible líder sindical.
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