La secuencia de persecución de autos en Las Vegas tomó cinco semanas de grabación y al final, la secuencia destruyó 170 autos.
Los productores pidieron permiso al gobierno griego para filmar la película en la ubicación real, pero debido a los altos impuestos y la burocracia, las escenas que tomaban lugar en Grecia tuvieron que ser filmadas en Tenerife, en las Islas Canarias.
Matt Damon declaró en numerosas ocasiones que solo regresaría a la serie de Bourne para repetir su papel de Jason Bourne si Paul Greengrass regresa para realizar tareas de dirección en el proyecto. Damon y Greengrass anunciaron su regreso en noviembre de 2014 para una nueva película.
Matt Damon admitió que entrenar físicamente para el papel de Bourne era mucho más difícil en sus cuarenta y que tuvo que seguir una dieta muy estricta para mantener su físico durante el rodaje.
Matt Damon y Julia Stiles son los únicos actores de la trilogía original que repiten sus papeles como Jason Bourne y Nicky Parsons, respectivamente.