El misterio del Padre Pío es un documental que mezcla el thriller, en el que se revela la verdadera historia del Padre Pío, uno hombre que fue canonizado por el papa Juan Pablo II. Sin embargo, antes de que la gente le profesara amor universal gracias a su conversión en santo, el Padre Pío fue perseguido por varias autoridades religiosas, luego de que se esparciera un terrible rumor sobre su vida privada. La gente aseguraba que él mantenía relaciones sexuales con sus hijas espirituales. Como era de esperarse, la rutina del Padre ya nunca fue la misma y constantemente sufrió ataques contra su persona. Esta película documental pretende limpiar el nombre de Pío y, además, comprabar que todo fue un complot urdido en su contra. La producción también hablará sobre las distintas habilidades que el Padre Pío poseía, entre ellas la biloación: la capacidad de estar en dos lugares al mismo tiempo.