Cygnus retrata la historia de Fabián, un astrónomo mexicano, quien a lo largo de su trayectoria ha buscado la evidencia de un descubrimiento que pondría su nombre en los anaqueles de la historia. Trabajando en el Gran Telescopio Milimétrico de México, situado en la cima de un volcán, aislado la mayor parte del tiempo, sus días pasan sin lograr acercarse a su objetivo final. Sin embargo, una noche descubre una señal misteriosa y sin traducción, proveniente de la constelación Cygnus, a 37,000 años luz de la Tierra. La señal, con características desconocidas, es comprobada por la computadora como real. Lo que empezó siendo la base de su gran descubrimiento pronto se torna en una pesadilla para Fabián, quien empieza a descubrir situaciones extrañas e inexplicables en el interior del observatorio. Escapando de un peligro latente y cada vez más cercano, Fabián sabe que la razón de todo es la misteriosa señal y deberá encontrar una forma de detenerla y revertir la situación.
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