La temporada sigue la batalla climática entre los Héroes con los estudiantes de la Escuela Secundaria UA, incluido Izuku Midoriya , y los villanos del Frente de Liberación Paranormal liderado por Tomura Shigaraki. Con información recopilada por Hawks, mientras están encubiertos en el grupo de villanos fusionados, los Héroes los enfrentan, lo que conduce a una guerra total que podría cambiar la sociedad sobrehumana. La segunda mitad de la temporada describe las secuelas de la guerra; los Héroes continúan salvando civiles y capturando villanos mientras lidian con sus bajas resultantes de la pérdida de la confianza del público.