Esta segunda temporada se encargará de adaptar dos arcos más del manga, por lo que Kobato y Osanai aún tendrán más misterios y casos por resolver. Su amistad y relación sin duda cambiará en esta segunda entrega, pues los dos comienzan a sentir ciertas cosas por el otro, lo cual los tomará por sorpresa ya que creían que su relación era un simple trato para poder llevar una vida tranquila y aunque lo intentaron, la vida los sigue rodeando de misterioso. Más casos extraordinarios, bizarros y fuera de lo común los estarán esperando, pero ¿estos jóvenes se animarán a seguir sus corazones?