La actriz Judith Hoag, en el papel de April, fue sustituida por Paige Turco, luego de que se quejó sobre los tratos injustos que reciben los dobles y especialistas de escenas de riesgo.
Dado que la primera película superó todas las expectativas, la producción no perdió el tiempo en dar luz verde a una secuela. Querían que esta película saliera a los cines lo antes posible, por lo que su continuación salió menos de un año después del lanzamiento de la primera película.
Debido a las críticas de los padres de familia, por el tono más oscuro y violento de la primera película, los productores decidieron, para la secuela, no permitir que las Tortugas usaran sus armas durante casi toda la película.
Es la única cinta de esta trilogía que no incluye al personaje de Casey Jones.
En la película original, las expresiones faciales de las tortugas fueron operadas por cable con todos los motores alojados en el caparazón. En esta película, gracias a un presupuesto mayor, los animatronics eran mucho más pequeños y livianos y se integraron en la propia cara.