Samuel Jones (Tommy Lee Jones) es un hombre rudo que durante años no ha visto a su hija Maggie Gilkeson (Cate Blanchett). Ella vive con sus dos hijas pequeñas en una solitaria pradera en Nuevo México en el año de 1885. No quiere saber nada de su padre, pues este las abandonó dos décadas antes para ir a vivir con los indios nativos del lugar. Cuando una víbora de cascabel muerde al hombre un curandero le indica que es tiempo de volver al lado de su familia. Al tocar la puerta de su hija el hombre solo recibe rechazo y es echado del lugar por la mujer. Al poco tiempo la hija mayor de Maggie es secuestrada por una banda de indios renegados que de dedican a raptar a pequeñas para venderlas posteriormente en México. Desesperada la mujer busca ayuda del alguacil local, pero este le dice que no puede ayudarle. Entonces ella decide recurrir a su propio padre quien buscará la oportunidad para redimirse. Las desapariciones es un western basado en una novela de Thomas Eidson.
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