En la tercera temporada, los alienígenas de Roswell y sus compañeros continúan recuperándose de los eventos del año anterior. Cuando una nueva amenazada y un viejo conocido está de vuelta, todos deben unir sus habilidades para evitar que un nuevo asesinato suceda. Mientras tanto, Liz y el equipo se cuestiona sobre a quienes dejan entrar en sus vidas, quienes los definen y si ellos realmente tienen poder sobre su propio futuro.