Jun Kunimura se graduó de un programa de teatro operado por Osaka Broadcasting Corporation, una compañía de teatro propiedad y operada por una filial local de NHK, antes de comenzar su carrera como actor con un pequeño papel en la película de 1973 de Shirō Moritani Submersion of Japan. Luego apareció en algunos dramas televisivos antes de tener su primer papel protagónico en Gaki Teikoku (1981) de Kazuyuki Izutsu. En 1989, protagonizó su primera película estadounidense, Lluvia negra, bajo la dirección de Ridley Scott. A finales de los 80 y principios de los 90, apareció en varias películas producidas en Hong Kong. En 2016, protagonizó la película de terror coreana de Na Hong-jin The Wailing, que le valió elogios de la crítica y el público, así como un premio al Mejor Actor de Reparto y Estrella Popular en los 37th Blue Dragon Film Awards, convirtiéndolo en el primer actor no coreano y japonés en ser nominado para el premio. En 2021 lo veremos en Kate (2021), una cinta de acción dirigida por Cedric Nicolas-Troyan.