Ahora el cazador de artefactos y arqueólogo Ben Franklin Gates (Nicolas Cage) se gana la vida dando conferencias sobre las contribuciones de su familia a los legados estadounidenses. Para su horro, otro autoproclamado patriota, Mitch Wilkinson, afirma que un antepasado de Gates fue un "autor intelectual" en el asesinato del presidente favorito de Ben, Abraham Lincoln. Ben emprende la búsqueda del diario del asesino, John Wilkes Booth, junto con su padre, Patrick, la archivera Abigail, su fiel discípulo Riley y su madre que se une al equipo como traductora, no solo para limpiar el nombre de su familia, sino también para descubrir y conectar varios secretos, enterrados en el libro, que apuntan a una conspiración masiva y global. En La búsqueda del tesoro perdido 2: El libro de los secretos, el equipo viaja de París a Londres y a Washington, D.C. para encontrar el evasivo diario, perseguidos por el FBI.
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