En 1969, durante la Guerra de Vietnam, el Coronel de las Fuerzas Especiales del Ejército de los Estados Unidos Walter E. Kurtz aparentemente se ha vuelto loco y en su puesto de vigilancia en Camboya, él ordena a los nativos de Montagnard que lo vean como un semidiós. El Coronel Lucas y el General Corman, cada vez más preocupados por las operaciones de Kurtz, asignan al Capitán Benjamin L. Willard para terminar con la vida de Kurtz. Entonces Willard, se une a un bote patrullero de la Marina de los Estados Unidos y viaja río arriba para cumplir con su misión. El viaje no será fácil: se darán varios percances tanto con la misma tripulación del bote como por las sorpresas que rodean a la jungla y los peligros de la guerra. En Apocalipsis, veremos cómo a medida que el capitán Willard se acerca al final de su misión, pronto se encuentra perturbado con los horrores de la guerra y en camino a perder la cordura.
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