Wesley Wales Anderson nació el 1 de mayo de 1969 en Houston, Texas, EE. UU. Sus padres se divorciaron cuando era pequeño, evento que marcó su vida y la de sus hermanos. Durante su infancia comenzó a escribir pequeñas obras de teatro y a hacer  películas en súper 8. Estudió en Westchester High School y luego en St. John's, una escuela privada en Houston, Texas que más tarde le serviría de inspiración para la película Academia Rushmore (1998).

Asistió a la Universidad de Texas en Austin, donde estudió filosofía y conoció a Owen Wilson. Pronto se hicieron buenos amigos y comenzaron a hacer cortometrajes, uno de estos fue Bottle Rocket (1994), protagonizada por Owen y su hermano Luke Wilson. El corto se proyectó en el Festival de Cine de Sundance, donde fue recibido con éxito, tanto que recibieron fondos para realizar una versión de largometraje. Realizó Ladrón que roba a otro ladrón (1996) que si bien no fue un éxito comercial, le ganó una audiencia de culto y admiradores de alto perfil como Martin Scorsese.

El éxito siguió con películas como Academia Rushmore (1998), Life Aquatic (2004), Los Tenenbaums. Una familia de genios (2001) y la película animada, Fantástico Sr. Fox (2009). Por las últimas dos cintas obtuvo nominaciones al Oscar. Sus últimas películas son El Gran Hotel Budapest (2014) e Isla de Perros (2018).