Después de la batalla de Nueva York el mundo no es el mismo: la existencia de los Avengers ha sido puesta en evidencia y también las terribles amenazas a las que el planeta se enfrenta. Tras resucitar de manera misteriosa, el agente Phil Coulson reunirá a un equipo conformado por cinco agentes S.H.I.E.L.D. para investigar posibles situaciones de riesgo para la humanidad. Los casos que el grupo investigará los irán acercando al Clarividente y sus peligrosos aliados que se hacen llamar a sí mismos Proyecto Ciempiés. Además, Coulson y sus nuevos reclutas deberán de trabajar desde las sombras, para detener a la organización secreta, HYDRA, quien trata de apoderarse de creaciones científicas para llevar a cabo ataques terroristas en el mundo. Mientras dirige a su equipo de agentes, Coulson intentará descifrar los misterios en torno a su propia muerte y resurrección en esta serie llena de acción que se interrelaciona varios momentos de las películas del Universo Cinematográfico de Marvel. Agents of S.H.I.E.L.D. tiene toda la genética de Marvel y promete entretener por horas a los amantes de los superhéroes.