Desarrollada en un mundo alternativo donde la ciencia, la teología y la magia están entrelazadas, los seres humanos cuentan con compañeros animales llamados daimonions, que son las manifestaciones del alma. La historia sigue la vida de Lyra Benacgua (Dafne Keen), una niña huérfana que vive con los profesores del Jordan College en Oxford. Cuando su mejor amigo desaparece, ésta se embarca en un peligroso viaje dónde termina involucrada en un siniestro complot liderado por el Lord Asriel (James McAvoy) y a la Sra. Marisa Coulter (Ruth Wilson). A lo largo de su travesía, conoce personajes bastante peculiares y descubre diversos universos mágicos llenos de criaturas fantásticas, como brujas hasta osos polares blindados. La materia oscura es una nueva adaptación de la trilogía de novelas de fantasía escritas por Philip Pullman, producida por Jane Tranter y Julie Gardner para las cadenas de televisión, BBC One y HBO.