En Star Wars: La Guerra de los Clones, que se desarrolla entre las películas El ataque de los clones y La venganza de los Sith, los caballeros Jedi Anakin Skywalker y Obi-Wan Kenobi se sumergen una vez más en el meollo de los problemas de la galaxia, ayudando a las tropas de la República a apoderarse de un planeta del ejército de robots liderado por el separatista Conde Dooku. En medio de la batalla, se enteran de que el Maestro Yoda le asignó a Anakin un nuevo estudiante: la valiente y joven Jedi Ahsoka Tano, cuyas habilidades solo se comparan con su impetuosidad. Cuando llega la noticia de que el hijo del gángster intergaláctico Jabba the Hutt ha sido secuestrado, Anakin y Ahsoka son enviados a rescatar al bebé, en parte con la esperanza de que un Jabba aplacado dé paso libre a los barcos de la República mientras intentan detener a los separatistas. Pero los separatistas tienen su propia agenda, y la asesina de Dooku, Asajj Ventress, está a la caza de Anakin y su nuevo alumno.